実験医学別冊 改訂 独習Pythonバイオ情報解析
出版社
羊土社
発行日
2025/02/10
判型
A4変
ページ数
444
ISBN
978-4-7581-2278-8
カテゴリ
本体価格 6,500円
(税込価格 7,150円)
(税込価格 7,150円)
【目次】
第1章 この本の使い方と事前準備【森 宙史】
第2章 生成AIを用いたプログラミング【東 光一】
第3章 Jupyter Notebookの使い方【谷澤靖洋】
第4章 Python速習コース【新海典夫】
第5章 文字列処理の基本 〜ファイルの読み書き，正規表現【高橋弘喜】
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 〜オブジェクト指向入門【谷澤靖洋】
第7章 pandasはじめの一歩 〜表形式データの扱い方【坂本美佳】
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 〜pandas実践編【坂本美佳】
第9章 データの可視化 〜Matplotlib，Seabornを用いたグラフ作成【孫 建強】
第10章 統計的仮説検定 〜RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで【森 宙史】
第11章 シングルセル解析① 〜テーブルデータの前処理【東 光一】
第12章 シングルセル解析② 〜次元削減【東 光一】
第13章 シングルセル解析③ 〜クラスタリング【東 光一】
付録A NumPy入門【東 光一】
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析【東 光一】
索引
第2章 生成AIを用いたプログラミング【東 光一】
第3章 Jupyter Notebookの使い方【谷澤靖洋】
第4章 Python速習コース【新海典夫】
第5章 文字列処理の基本 〜ファイルの読み書き，正規表現【高橋弘喜】
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 〜オブジェクト指向入門【谷澤靖洋】
第7章 pandasはじめの一歩 〜表形式データの扱い方【坂本美佳】
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 〜pandas実践編【坂本美佳】
第9章 データの可視化 〜Matplotlib，Seabornを用いたグラフ作成【孫 建強】
第10章 統計的仮説検定 〜RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで【森 宙史】
第11章 シングルセル解析① 〜テーブルデータの前処理【東 光一】
第12章 シングルセル解析② 〜次元削減【東 光一】
第13章 シングルセル解析③ 〜クラスタリング【東 光一】
付録A NumPy入門【東 光一】
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析【東 光一】
索引
【記事】
Pythonの定番テキストが待望の改訂！大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から，シングルセル，RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます．サンプルデータとコード見本付きで，今日から実践しながら学べます．改訂では，生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し，各種ライブラリのアップデートに対応しました．